الوحدات

 وحدة البحوث :

تضطلع بمهمة إعداد وتطوير البحوث النظرية والتطبيقية وتطوير النماذج والأساليب المساعدة في مجالات التنمية المستدامة، كما تضطلع بمهمة تحرير المادة العلمية المعدة للنشر داخل المركز.

وحدة بناء الوسع (القدرات) والاستشارات:

تضطلع بمهمة تنظيم الندوات والمؤتمرات والدورات التدريبية وتقديم الاستشارات العلمية في مجال التنمية المستدامة.

 وحدة المعلومات والتوثيق:

 وتضطلع بأنشطة  المعلومات وتطوير قواعد البيانات عن الخبراء والمعلومات المتصلة بالتنمية المستدامة، وتوثيق الجهود الرسمية وغير الرسمية في السودان ودول العالم الإسلامي وجهود المجتمعات الإسلامية عموماً في مجال التنمية المستدامة.